المجلة العلمية لجامعة الملك فيصل
العلوم الأساسية والتطبيقية
المجلة العلمية لجامعة الملك فيصل / العلوم الأساسية والتطبيقية
الكشف عن معزز محتمل لنمو النبات من خلال تحليل الجينوم الكامل In Silico للسلالة Bacillus Rhizoplanae CIP111899
(ضيف القندوز و زيتوني عبدالغني)
الملخص
تهدف هذه الدراسة إلى تحليل الجينوم الكامل لسلالة بكتيرية CIP111899 معزولة من سطح جذور الذُرة Zea mays قصد الكشف عن وجود جينات متدخلة في تعزيز نمو النبات وكذا في النشاط المضاد لمسببات الأمراض النباتية التي تُكبّد الإنسانية خسائر فادحة في الأمن الغذائي، لقد مكّنت الدراسة التصنيفية الجينومية من إثبات انتماء السلالة CIP111899 لنوع بكتيري جديد Bacillus rhizoplanae. في خطوة لاحقة إذ تم التحليل الجينومي للسلالة CIP111899 على عدة مستويات وبعدة أدوات معلوماتية كدراسة للجينات المرتبطة بالفئات الوظيفية (COG) من خلال عملية التحليل الجيني (Annotation) وذلك بواسطة خادم RAST ثم التحديد الجيني عن طريق برنامج Prokka ليتم الكشف والتعرف على الجينات المتعلقة بآليات تعزيز نمو النبات والمكافحة البيولوجية ثم البحث عن المجموعات الجينية المسؤولة عن الأيض الثانوي بواسطة أداة التحليل البرمجية .antiSMASH التي أظهرت نتائج التحليل الجيني للسلالة CIP111899، حيث تمّ اكتشاف العديد من الجينات المساهمة في تحمل الإجهادات في جينوم CIP111899 مثل الجينات المشفِّرة المنتجة لإنزيمات ومركبات مضادة للأكسدة (antioxidants) وإنتاج الجذور الحرة المجهِدة للنبات والتي من أهمها على سبيل المثال : سوبر أكسيد ديسمتاز (SOD)، البيروكسيداز (POXs) وكاتلاز (CAT). و كذلك تم العثور على عديد الجينات المتعلقة بصفات تعزيز نمو النبات كإذابة الفسفور اللاعضوي، وإنتاج الهرمونات النباتية والتقاط الحديد، وفي الختام يتّضح من خلال مجمل النتائج المحصل عليها أهمية السلالة CIP111899 كمرشح واعد في تعزيز نمو النباتات والمساهمة في الأمن الغذائي.
المراجع